Кто весел — тот смеётся,
Кто хочет — тот добьётся, Кто ищет — тот всегда найдёт!
Поиск
QB.SDM V5 - моделирование эмпирического ареала вида
Друзья, представляем систему моделирования эмпирического ареала видов - Qb.SDM.
Суть SDM - поиск закономерностей между местами наблюдения вида и условиями окружающей среды в этих местах.
Примеры источников наблюдательных данных: GBIF, iNaturalist, eBird, birds.kz, wingeds.world, plantarium.su и др.
Условия среды: WorldClim (температура, осадки), SRTM (рельеф, высоты), OSM (речные и дорожные сети) и др.
Для запуска SDM обычно нужно провести большую работу по сбору и подготовке этих данных.
Цель Qb.SDM - избавить вас от этой работы. Модель можно запустить здесь и сейчас.
Птицы, млекопитающие, рептилии, насекомые, растения - пробуйте всё.
Основные входные параметры:
Модель:
Набор биоклим. переменных:
Порог вероятности:
Ширина буфера α-об.:
Регион:
Фон. точки и псевдоотсутствия:
Шаг модели:
Сезонность:
* для первого запуска оставьте значения по умолчанию
Точки присутствия вида:
Файл в формате csv, zip: (можно из GBIF)
Либо вы можете вставить ваши данные
из буфера обмена в текстовое поле справа:
** в модель необходимо передать набор координат наблюдений (широта; долгота).
Формат csv. В первой строчке должны быть значения "lat";"lon". Разделитель - символ табуляции.
Минимальный набор - 20 точек, желательно максимально разнообразные по условиям среды. Оптимально - сотни и более точек.
Результаты моделирования:
id процесса:
...
Модель:
...
Вид:
...
Координаты:
...
Загружено предикторов:
...
Слои:
...
Всего записей в CSV:
...
Присутствий внутри валидной области:
...
Уникальных присутствий (по пикселю):
...
Параметры фоновых точек и точек псевдоприсутствия:
...
Сэмплировано фоновых точек:
...
Сэмплировано точек псевдоприсутствия:
...
ROC AUC (holdout):
...
Важность предикторов:
...
Распределение присутствий по предикторам:Подождите несколько минут...
Карта SDM:Подождите несколько минут...
Прогноз изменения эмпирического ареала/ENM:
* в текущей версии прогноз строится только на основании WorldClim 2.1 future climate data
** с точки зрения терминологии для прогноза корректнее использовать термин ENM - моделирование экологической ниши.
Подробнее. Подождите несколько минут...
Подробнее о слоях биоклиматических переменных:
Модель Qb.SDM работает со следующим набором слоёв биоклиматических переменных - предикторов:
1. WorldClim 2.1. Подробнее: https://www.worldclim.org/data/worldclim21.html.
Цитата: Fick, S.E. and R.J. Hijmans, 2017. WorldClim 2: new 1km spatial resolution climate surfaces for global land areas. International Journal of Climatology 37 (12): 4302-4315.
2. WorldClim 2.1 future climate data. Подробнее: https://www.worldclim.org/data/cmip6/cmip6climate.html.
Цитата: We acknowledge the World Climate Research Programme, which, through its Working Group on Coupled Modelling, coordinated and promoted CMIP6. We thank the climate modeling groups for producing and making available their model output, the Earth System Grid Federation (ESGF) for archiving the data and providing access, and the multiple funding agencies who support CMIP6 and ESGF.
3. ENVIREM. Подробнее: https://envirem.github.io/.
Цитата: Title P.O., Bemmels J.B. 2018. ENVIREM: an expanded set of bioclimatic and topographic variables increases flexibility and improves performance of ecological niche modeling. Ecography. 41:291–307.
4. EarthEnv Land Cover. Подробнее: https://www.earthenv.org/landcover.
Цитата: Tuanmu, M.-N. and W. Jetz. 2014. A global 1-km consensus land-cover product for biodiversity and ecosystem modeling. Global Ecology and Biogeography 23(9): 1031-1045.
5. SoilGrids. Подробнее: https://docs.isric.org/globaldata/soilgrids/.
Цитата: Common soil chemical and physical properties: Poggio, L., de Sousa, L. M., Batjes, N. H., Heuvelink, G. B. M., Kempen, B., Ribeiro, E., and Rossiter, D.: SoilGrids 2.0: producing soil information for the globe with quantified spatial uncertainty, SOIL, 7, 217–240, 2021. DOI
Soil water content at different pressure heads: Turek, M.E., Poggio, L., Batjes, N. H., Armindo, R. A., de Jong van Lier, Q., de Sousa, L.M., Heuvelink, G. B. M. : Global mapping of volumetric water retention at 100, 330 and 15 000 cm suction using the WoSIS database, International Soil and Water Conservation Research, 11-2, 225-239, 2023. DOI
Друзья, представляем систему моделирования эмпирического ареала видов - Qb.SDM.
